Udako Zientzia Gida: 40 °C-ko bero-bolada batek esperimentu molekularrak betetzen dituenean

Azkenaldian, tenperatura altuak mantendu dira Txinako zati handi batean. Uztailaren 24an, Shandong probintziako meteorologia behatokiak tenperatura altuen alerta horia eman zuen, barnealdeko eremuetan 35-37 °C-ko (111-133 °F) "saunaren antzeko" tenperaturak eta % 80ko hezetasuna iragarriz datozen lau egunetarako. Turpan bezalako lekuetan, Xinjiang-en, tenperaturak 48 °C-ra (111-133 °F) hurbiltzen ari dira. Wuhan eta Xiaogan, Hubei-n, alerta laranja batean daude, zenbait eremutan 37 °C-tik gorako tenperaturekin. Bero sargori honetan, pipeten azpiko mundu mikroskopikoak asaldura ezohikoak jasaten ari da: azido nukleikoen egonkortasuna, entzimen jarduera eta erreaktiboen egoera fisikoa isilean desitxuratzen ari dira bero-boladak.

Azido nukleikoen erauzketa denboraren aurkako lasterketa bihurtu da. Kanpoko tenperatura 40 °C-tik gorakoa denean, aire girotua piztuta egon arren, ebakuntza-mahaiaren tenperatura askotan 28 °C-tik gorakoa da. Garai honetan, aire zabalean uzten diren RNA laginak udaberrian eta udazkenean baino bi aldiz azkarrago degradatzen dira. Ale magnetikoen erauzketan, buffer-soluzioa lokalki saturatuta dago disolbatzailearen lurruntze bizkortuaren ondorioz, eta kristalak erraz hauspeatzen dira. Kristal hauek azido nukleikoaren harrapaketa-eraginkortasunean gorabehera handiak eragingo dituzte. Disolbatzaile organikoen lurrunkortasuna aldi berean handitzen da. 30 °C-tan, kloroformoaren lurruntze-kopurua % 40 handitzen da 25 °C-rekin alderatuta. Funtzionamenduan zehar, ziurtatu behar da ke-kanpaian haizearen abiadura 0,5 m/s-koa dela, eta nitrilozko eskularruak erabili babes-eraginkortasuna mantentzeko.

PCR esperimentuek tenperatura-asaldura are konplexuagoei aurre egin behar diete. Taq entzima eta alderantzizko transkriptasa bezalako erreaktiboak oso sentikorrak dira tenperatura-gorabehera bat-batekoekiko. -20 °C-ko izozkailutik atera ondoren hodi-paretetan kondentsazioa sortzen bada, % 15 baino gehiagoko entzimaren jarduera-galera eragin dezake erreakzio-sisteman sartzen bada. dNTP soluzioek degradazio detektagarria ere erakuts dezakete giro-tenperaturan (> 30 °C) 5 minutu igaro ondoren. Tresnaren funtzionamendua ere tenperatura altuek oztopatzen dute. Laborategiko giro-tenperatura > 35 °C denean eta PCR tresnaren bero-xahutze-tartea nahikoa ez denean (< 50 cm hormatik), barne-tenperatura-aldea 0,8 °C-ra irits daiteke. Desbideratze horrek 96 putzuko plaka baten ertzean anplifikazio-eraginkortasuna % 40 baino gehiago jaistea eragin dezake. Hauts-iragazkiak aldizka garbitu behar dira (hauts-metaketan bero-xahutze-eraginkortasuna % 50 murrizten da), eta aire girotua zuzenean saihestu behar da. Gainera, PCR esperimentuak gauez egiten direnean, saihestu PCR tresna laginak gordetzeko "hozkailu inprobisatu" gisa erabiltzea. 4 °C-tan 2 ordu baino gehiago gordetzeak kondentsazioa sor dezake berotutako tapa itxi ondoren, erreakzio-sistema diluitu eta tresnaren metalezko moduluak korrosioa eraginez.

Tenperatura altuko abisu iraunkorren aurrean, laborategi molekularrek ere alarma jo beharko lukete. RNA lagin preziatuak -80 °C-ko izozkailu baten atzealdean gorde behar dira, tenperatura altuko aldietarako sarbidea mugatuta. -20 °C-ko izozkailu baten atea egunean bost aldiz baino gehiago irekitzeak tenperatura gorabeherak areagotuko ditu. Bero handia sortzen duten ekipoek gutxienez 50 cm-ko beroa xahutzeko espazioa behar dute bi aldeetan eta atzealdean. Gainera, esperimentuen ordutegia berregituratzea gomendatzen da: 7:00-10:00 tenperaturarekiko sentikorrak diren eragiketetarako, hala nola RNA erauzketa eta qPCR kargatzea; 13:00-16:00 esperimentalak ez diren lanetarako, hala nola datuen analisietarako. Estrategia honek eraginkortasunez eragotzi dezake tenperatura altuko gailurrek urrats kritikoetan interferentziak egitea.

Beroaldi batean esperimentu molekularrak teknikaren eta pazientziaren proba dira. Udako eguzki etengabearen azpian, agian pipeta utzi eta izotz-kaxa gehigarri bat gehitzeko garaia da laginei, tresnak bero gehiago xahu dezan. Tenperatura-gorabeherekiko errespetu hori da, hain zuzen ere, laborategiko kalitaterik preziatuena udako hilabete beroetan; azken finean, udako 40 °C-ko beroan, molekulek ere arretaz zaindutako "eskualde polar artifizial" bat behar dute.